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快速菌膜鑒定,真的可以嘗試嗎?

2024-07-03 09:35:50

為了縮短鑒定時(shí)間,快速提供臨床可信賴(lài)的結果,在以“為所有膿毒癥患者提供48小時(shí)內***低抑菌濃度藥敏結果”為目標的膿毒癥全流程解決方案中,MALDI-TOF MS是實(shí)現快速鑒定分***報告的重要環(huán)節。針對陽(yáng)性血培養進(jìn)行快速質(zhì)譜鑒定能夠進(jìn)***步免去隔夜傳代培養時(shí)間,從而加速報告。因此,陽(yáng)性血培養的快速鑒定方法成為大多數實(shí)驗室關(guān)注的焦點(diǎn)。


2019年,歐洲臨床微生物學(xué)和傳染病學(xué)會(huì )(ESCMID)發(fā)起了***項基于微生物實(shí)驗室血培養流程的現狀調研,其中37.3%(78/209)的實(shí)驗室進(jìn)行了血培養菌膜的快速鑒定。


本文分享了三篇應用VITEK MS的研究,研究從固體培養基上挑選短時(shí)孵育(從常規的16-24小時(shí)孵育縮短到4-8小時(shí))的菌膜進(jìn)行直接鑒定。相較于直接從陽(yáng)性血培養物中提取鑒定細菌,這種方法操作更加方便,并且減少了肉湯培養基和血液對鑒定結果的干擾因素。




文獻***

VITEK MS短時(shí)孵育3h、5h的鑒定成功率[1]

意大利都靈大學(xué)醫學(xué)院共入組了162例單微生物血液培養物,其中121例為革蘭氏陰性菌株(占74.7%),32例為革蘭氏陽(yáng)性菌株(占19.8%),以及9例酵母菌株(占5.6%)。研究發(fā)現,質(zhì)譜在種水平鑒定上的準確性與傳統方法相比,在3小時(shí)、5小時(shí)和24小時(shí)的時(shí)間點(diǎn)分別達到60.5%、80.2%和93.8%的***致性。


對于革蘭氏陰性菌,腸桿菌科的鑒定率***高;對于革蘭氏陽(yáng)性球菌,金黃色葡萄球菌的鑒定結果***好(鑒定成功率為***)。此外,研究發(fā)現,凝固酶陰性葡萄球菌(CoNS)在培養5小時(shí)后就獲得了良好的鑒定結果(鑒定成功率為88.2%),且沒(méi)有被誤認為金黃色葡萄球菌,這無(wú)疑是快速區分真正的病原體及可能的污染的有效方法。


然而,在***篇關(guān)于某***際進(jìn)口品牌B評估的文章中,研究對435個(gè)單微生物培養物進(jìn)行了快速鑒定。結果顯示,在傳代短時(shí)孵育5小時(shí)后,金黃色葡萄球菌的鑒定成功率為79.5%,而凝固酶陰性葡萄球菌(CoNS)的鑒定成功率為53.8%[2]。

VITEK MS從建庫菌株的多樣性出發(fā),同時(shí)考慮操作人員和培養條件的差異,采用權重矩陣算法構建準確數據庫。這是目前唯***能夠提供單***臨床診斷結果的平臺,無(wú)需在多個(gè)鑒定結果中進(jìn)行選擇,從而將報告結果錯誤的風(fēng)險降至***低。該平臺可以為臨床提供準確且快速的二***鑒定報告。


文獻二

VITEK MS短時(shí)孵育6h、8h的鑒定成功率[3]

芝加哥大學(xué)醫學(xué)院共收集了134例血培養陽(yáng)性樣本,這些樣本被直接轉種至預熱1小時(shí)的血平板,并在培養2、4、6、8、10小時(shí)后進(jìn)行評估,無(wú)需進(jìn)行乙醇-甲酸蛋白質(zhì)提取。研究發(fā)現,在培養4小時(shí)后,陰性菌的正確鑒定率達到94%;在培養6小時(shí)后,陽(yáng)性菌的正確鑒定率達到98%。


總體上,培養6小時(shí)后的總鑒定成功率超過(guò)90%;培養8小時(shí)后,總鑒定成功率達到95%。



文獻三

VITEK MS PRIME

短時(shí)孵育3-4h菌膜鑒定成功率[4]

VITEK MS PRIME是2024年新上市的質(zhì)譜系列產(chǎn)品,完全延續了VITEK? MS在數據庫和算法上的可靠性,同時(shí)改善了操作流程的體驗感。實(shí)驗室可隨時(shí)加載靶板并調整檢測優(yōu)先***,***多支持16張靶板同時(shí)在線(xiàn),可在實(shí)驗室任意電腦上進(jìn)行信息錄入及結果查看,將人在設備面前的等待時(shí)間降至零,優(yōu)化了鑒定流程。該系統更高效地實(shí)現了與LIS分***報告及VITEK 2藥敏流程的對接,從而節省人力、提升TAT(周轉時(shí)間),并支持臨床更早從經(jīng)驗治療轉向目標治療。


***項納入218株菌的臨床實(shí)驗數據顯示,VITEK MS PRIME在3-4小時(shí)培養(菌膜)后的鑒定成功率高達70.2%,而某***際進(jìn)口品牌B的成功率為55.5%。


準確且快速的二***鑒定報告的發(fā)出,必須基于***個(gè)穩定且可靠的數據庫,并配合信息化的全流程溯源,才能真正助力微生物實(shí)驗室在血流感染患者中的抗菌藥物治療。需要注意的是,在使用菌膜進(jìn)行二***報告鑒定前需進(jìn)行性能驗證,對于無(wú)法通過(guò)此方法識別的微生物(例如,血培養混合感染樣本、革蘭氏陽(yáng)性桿菌、厭氧菌及酵母菌等),仍需通過(guò)過(guò)夜培養以獲得成熟菌落進(jìn)行識別。


目前,***內已有多***實(shí)驗室實(shí)現了鑒定時(shí)間少于32小時(shí)的二***報告。中***科學(xué)技術(shù)大學(xué)附屬醫院評估并比較了使用VITEK MS進(jìn)行的快速微生物鑒定與常規微生物鑒定對血流感染住院患者抗生素使用、臨床結局和衛生經(jīng)濟學(xué)的影響。研究顯示,引入VITEK MS后,從入院到***次目標性抗生素治療的時(shí)間縮短了28.7小時(shí)(p<0.001),平均住院時(shí)間縮短了5.9天(p<0.001),平均節省抗生素費用7300元(1021美元)(p<0.001),平均住院費用節省24078元(3368美元)(p<0.001)。該研究?jì)热菀舶l(fā)表在2024年ECCMID(Poster NO:P0874)。

參考文獻:

[1] Curtoni A, Cipriani R, Marra ES, Barbui AM, Cavallo R, Costa C. Rapid Identification of Microorganisms from Positive Blood Culture by MALDI-TOF MS After Short-Term Incubation on Solid Medium. Curr Microbiol. 2017;74(1):97-102. 

[2] Pranada AB, Cordovana M, Meyer M, et al. Identification of micro-organism from positive blood cultures: comparison of three different short culturing methods to the Rapid Sepsityper workflow. J Med Microbiol. 2022;71(8):10.1099

[3] Bhatti MM, Boonlayangoor S, Beavis KG, Tesic V. Rapid identification of positive blood cultures by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry using prewarmed agar plates. J Clin Microbiol. 2014;52(12):4334-4338. 

[4] Grohs P, Remaud E, Lath C, et al. Comparison of the New VITEK MS PRIME System with the Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Biotyper Microflex LT for the Identification of Microorganisms. Ann Lab Med. 2023;43(6):574-584.


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