資料簡(jiǎn)介：

賽默飛ABI Ion PGM|Ion Proton快速高通量測序基因測序儀簡(jiǎn)介

Life Technologies 公司研發(fā)的 Ion Proton? 基因測序儀采用了新***代半導體測序技術(shù)。此前推出的同樣基于這***技術(shù)的個(gè)人化操作基因組測序儀 (PGM? ) ，已成為全球銷(xiāo)售*快的測序儀。Ion 技術(shù)擁有快速、簡(jiǎn)單及可擴展等特征，能有效推進(jìn)臨床研究在遺傳性疾病等診斷中的發(fā)展。

2. 應用領(lǐng)域

可應用于人全基因組、外顯子組、轉錄組測序。

3. 性能介紹

1) 單芯片載入中：為實(shí)現優(yōu)化的性能和簡(jiǎn)便性，IonProton?系統提供了全新設計的芯片加載機制。

2) 集成的試劑輸送：IonProton?測序儀將所有試劑置于儀器前方的單扇門(mén)之后，十分方便。

3) 直觀(guān)的圖形界面：Ion Proton?測序儀采用了全新設計且易于使用的直觀(guān)圖形界面，確保了各個(gè)水平的用戶(hù)均能通過(guò)儀器設置和操作快速導航。

4) *先進(jìn)的電子產(chǎn)品：Ion Proton?測序儀采用了先進(jìn)的電子技術(shù)，可*大程度地簡(jiǎn)化處理高通量系統生成的數據所需的計算硬件。

5) 離子半導體測序芯片：Ion Proton?芯片只需幾小時(shí)即可提供人類(lèi)基因組、人類(lèi)外顯子組或整個(gè)轉錄組信息，較其它測序技術(shù)更快速。

4. 數據產(chǎn)出

單次運行時(shí)間為2h，Ion PI?芯片包括16,500萬(wàn)個(gè)反應孔，測序通量為2個(gè)人外顯子組大小，Ion PII?芯片包括66,000萬(wàn)個(gè)反應孔，測序通量為1個(gè)人基因組大小。

5. 工作流程

文庫構建-模板制備-運行測序-分析數據

6. 系統數據處理編輯

采用先進(jìn)的硬件可實(shí)現***天基因組測序

IonProton?系統是能夠實(shí)現$1,000基因組的序平臺*。它將是可在***天內提供人類(lèi)基因組規模分析的臺儀器系統，包括數據處理、堿基檢測和變異體檢測。

IonProton?系統采用半導體技術(shù)，可提供在幾個(gè)小時(shí)內完成測序所需的速度，而且利用IonProton?測序儀中先進(jìn)的電子設備，能夠***天內在Proton?Torrent服務(wù)器—IonProton?系統附帶的簡(jiǎn)單的臺式服務(wù)器—上實(shí)現變異體檢測。

IonProton?測序儀采用了*新、*先進(jìn)的計算硬件(圖形處理器(GPU)和現場(chǎng)可編程門(mén)陣列(FPGA)技術(shù))，可在測序儀內部實(shí)現密集型計算數據處理。隨后在Proton?Torrent服務(wù)器上進(jìn)行計算密集程度較低的堿基檢測和變異體檢測。

IonProton?系統將提的速度和價(jià)格優(yōu)勢，可在臺式測序儀和臺式服務(wù)器上實(shí)現外顯子組、轉錄組和人類(lèi)基因組測序，而直到現在，完成這些操作仍需體積較大的測序儀和高端集群。

7. 優(yōu)勢編輯

IonProton?測序儀憑借密度比IonPGM?測序儀高1000倍的芯片，IonProton?測序儀將使得全基因組測序對每個(gè)實(shí)驗室都觸手可及。

基于新***代的半導體測序技術(shù)，此技術(shù)已讓IonPGM?測序儀成為世界上銷(xiāo)售*快的測序儀.新的高通量芯片將實(shí)現讓IonProton?測序儀與IonPGM?測序儀相當的運行單日流程，來(lái)完成單個(gè)人類(lèi)基因組的測序。

適合于每個(gè)實(shí)驗室，各種應用，各種預算。

快速、簡(jiǎn)捷、擴展，臺式基因組中心。

天津金思德生物擁有中低通量的Ion Torrent PGM Systems和中高通量的Ion Torrent Proton Systems，為用戶(hù)提供專(zhuān)業(yè)全套的二代測序實(shí)驗室整體解決方案。

賽默飛ABI Ion PGM|Ion Proton快速高通量測序基因測序儀特點(diǎn)：
  快的高通量新***代測序工作流程與快的測序運行時(shí)間2-4小時(shí)的離子PI芯片
 每周高數量完整測序的運行，具有簡(jiǎn)單和自動(dòng)化的工作流（與離子的OneTouch2系統中使用時(shí)）
 簡(jiǎn)單的半導體測序工作流程與強大的和簡(jiǎn)單的硬件，可以在-沒(méi)有攝像頭的依據，沒(méi)有光學(xué)，沒(méi)有激光
 可擴展，高通量測序能力，使運行時(shí)要么離子PI或離子的PII*芯片，再加上高達200基單讀取和靈活的庫選項（例如，基因組DNA片段，
有針對性的/外顯子，RNA）
 小型臺式足跡和安裝能力（帶有可選的機架）（每個(gè)機架上有兩個(gè)離子質(zhì)子系統），為客戶(hù)提供唯的臺式基因組中心
 低成本的平臺和價(jià)格誘人的半導體芯片和試劑的應用范圍
 經(jīng)過(guò)驗證的離子半導體測序無(wú)需復雜的光學(xué)系統，并采用天然的核苷酸，以提供高度準確的變異檢測，覆蓋均勻性和靈敏度，檢測低頻率變量
 快速和簡(jiǎn)單的解決方案庫范圍和試劑盒與各種應用，如基因組測序，外顯子組測序，基因組測序和RNA測序低投入的要求
 完整的端至端解決方案，從基本要求與質(zhì)子洪流服務(wù)器和洪流，以變種Suite軟件V3.0 
 簡(jiǎn)單和集成的工具，三***數據分析與跨越單***離子記者軟件進(jìn)行DNA變異分析，配對，或者三人的樣本有了突破性離子質(zhì)子系統的可用性，
快速，高通量測序終于進(jìn)入所有實(shí)驗室。
負擔得起的測序幾乎每***個(gè)實(shí)驗室上***頁(yè)測序技術(shù)都依賴(lài)于光學(xué)系統的化學(xué)和序列信息的數字形式之間的橋梁。這些系統增加了巨大的成本來(lái)定序，
他們貶謫到只有大的實(shí)驗室。通過(guò)省去了光學(xué)系統，離子質(zhì)子系統提供了高通量測序更簡(jiǎn)單，更快速，更具成本效益，
并比其他任何可用的技術(shù)更具可擴展性。與臺式足跡，低成本的測序試劑，和***個(gè)簡(jiǎn)單的觸摸屏用戶(hù)界面，離子質(zhì)子系統帶來(lái)了高吞吐量，
下***代測序幾乎每***個(gè)實(shí)驗室。
離子動(dòng)力：PostLight測序產(chǎn)生位從基地的測序技術(shù)的基礎離子質(zhì)子系統利用了充分表征的生化過(guò)程：當***個(gè)核苷酸摻入到DNA鏈通過(guò)聚合酶，
氫離子（H +）被釋放作為副產(chǎn)物。這種氫離子帶電荷的質(zhì)子系統的離子傳感器本質(zhì)上是世界上小的固態(tài)pH計，可以檢測到。
由于序充斥芯片與***個(gè)又***個(gè)核苷酸，核苷酸任何添加到DNA模板將被檢測為電壓的變化，以及離子質(zhì)子系統會(huì )調用基。
如果***個(gè)核苷酸是不匹配的特定模板，沒(méi)有電壓變化將被檢測并沒(méi)有基礎，直接調用該模板。
大規模平行測序在你的臺式離子質(zhì)子系統的***個(gè)主要組成部分是測序芯片。離子PI芯片集成了***個(gè)非常密集陣嫁給我們的專(zhuān)有離子傳感器> 1.65億微機械井。
每孔包含不同的DNA模板，使大規模并行測序。與離子PI芯片（1.65億井）和離子的PII芯片*（6.6億井），離子質(zhì)子系統能使全轉錄到
整個(gè)人類(lèi)基因組測序的范圍從以人為尺度的外顯子組測序的高通量基因組應用。
正確的工具來(lái)獲得的成績(jì)輕松，可靠并迅速因為它檢測核苷酸摻入無(wú)需使用光，離子質(zhì)子系統采用簡(jiǎn)單的測序化學(xué)可能：天然核苷酸。
沒(méi)有必要使用昂貴的且易于出錯的修飾的堿基，酶***聯(lián)反應，化學(xué)發(fā)光，或熒光。直接檢測也意味著(zhù)每個(gè)核苷酸的摻入被記錄在幾秒鐘。
因此，你可以做***個(gè)完整的測序通常在幾小時(shí)內運行。

Ion PGM & Ion Proton

快速高通量測序解決方案

Ion Torrent是革新性的半導體芯片測序技術(shù)平臺?，F在，Invitrogen項目服務(wù)部將Ion PGM和Ion Proton快速精確的測序服務(wù)帶到您身邊。

Ion AmpliSeq技術(shù)——運用超多重PCR擴增捕獲目的區域，進(jìn)行半導體高通量測序和數據分析。

優(yōu)點(diǎn)：
? 僅需痕量樣品-起始模板DNA低至10ng，適用于珍貴樣品
? 高效靶向覆蓋-運用多重PCR設計實(shí)現平均97%靶向覆蓋
? 讀長(cháng)-可選擇200bp或400bp讀長(cháng)

外顯子組測序

超多重PCR外顯子捕獲技術(shù)，覆蓋97%以上的外顯子區域，60 X以上的測序深度。
提供SNP和In/Del變異檢測分析，利用dbSNP和Genome 1000進(jìn)行變異注釋及氨基酸突變注釋。

BAC/Fosmid質(zhì)粒測序：

非模式生物基因組測序工程輔助平臺

細菌基因組de novo和重測序：

2011年德***腸出血性大腸桿菌疫情由Ion PGM平臺先完成測序鑒定

病毒基因組測序：

快速發(fā)現新型病毒

腫瘤基因靶向測序

◆ Cancer Hotspot Panel V2： 靶向50個(gè)原癌及抑癌基因，覆蓋約2800個(gè)已知外顯子突變位 點(diǎn)，高4000 X測序深度。
◆ Comprehensive Cancer Panel：靶向409個(gè)引用次數多及突變頻繁的關(guān)鍵原癌及抑癌基因，350 X以上測序深度。
◆ BCRA1/2 Panel：特異性針對乳腺癌/宮頸癌BCRA1/2檢測，1000 X以上測序深度。 Angelina Jolie通過(guò)基因診斷降低乳腺 癌發(fā)病風(fēng)險引起全球熱議。
◆ Colon and Lung Cancer Panel：特異性靶向結腸癌、肺癌相關(guān)22個(gè)基因熱點(diǎn)區域，1500 X以上的測序深度。

遺傳病基因檢測

◆ Inherited Disease Panel： 涵蓋 700多種常見(jiàn)孟德?tīng)栠z傳病相關(guān)的328個(gè)基因 當基因組位置的測序覆蓋度 >20x時(shí)，生殖細胞系突變檢測>90% 神經(jīng)肌肉疾病涉及237種疾病中88個(gè)基因 心臟病涉及143種疾病中61個(gè)基因 發(fā)育疾病涉及143種疾病中61個(gè)基因 代謝疾病涉及44種疾病中28個(gè)基因 其他典型遺傳性疾病涉及196種疾病中75個(gè)基因

Ion AmpliSeq? Custom Panel：根據研究興趣設計并定制目的基因的測序服務(wù)，可靈活選擇測序深度

高通量測序驗證平臺

PCR測序法：

針對客戶(hù)感興趣的DNA區域，我們 提供引物設計和合成、PCR擴增、ABI3730測序和實(shí)驗結果的初步分析。

MGB探針?lè )ǎ?/p>

根據DNA序列設計特異性引物和探針、熒光定量PCR和實(shí)驗結果分析。

SNaPshot法：

根據DNA序列設計特異性引物、多重PCR進(jìn)行單堿基延伸、3730毛細管電泳掃描和實(shí)驗結果分析。

質(zhì)譜法：

根據DNA序列設計特異性引物、多重PCR進(jìn)行單堿基延伸、質(zhì)譜檢測和實(shí)驗結果分析。